ภาควิชาจักษุ โสต ศอ นาสิกวิทยา ได้ก่อตั้งขึ้นพร้อมกับคณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ ตามประกาศในหนังสือราชกิจจานุเบกษา  ลงวันที่ 6 ตุลาคม 2515  ในการดำเนินงานเริ่มแรกได้ปฏิบัติงานร่วมกับภาควิชาโสต นาสิก ลาริงซ์วิทยา โดยมีชื่อร่วมกันว่า ภาควิชาจักษุ โสต นาสิก ลาริงซ์วิทยา โดยมีอาจารย์แพทย์หญิงพวงศล  รัตนไพศาลเป็นหัวหน้าภาควิชาฯและเป็นจักษุแพทย์ท่านแรก  ต่อมาจึงมีอาจารย์นายแพทย์ไสว ลิมปิษเฐียร และอาจารย์แพทย์หญิงมันทนีย์ไพรัชเวทย์

       หลังจากนั้นภาควิชาจักษุวิทยาได้แยกออกจากภาควิชาโสตนาสิก ลาริงซ์วิทยาอย่างเป็นทางการเมื่อวันที่ 9 สิงหาคม พ.ศ. 2531 โดยมีอาจารย์นายแพทย์นิมิต รัตนมาศ เป็นหัวหน้าภาควิชา 

       ในส่วนการดำเนินงานของภาควิชาฯ นั้น เริ่มเมื่อคณะแพทยศาสตร์ตั้งสำนักงานชั่วคราวบริเวณชั้นล่างคณะวิศวกรรมศาสตร์ ต่อมาในปี พ.ศ. 2522 ได้ย้ายสำนักงานภาควิชามาอยู่ที่ชั้น 4 อาคารบริหาร คณะแพทยศาสตร์และเมื่อปี พ.ศ. 2525 ได้ย้ายมาตั้งสำนักงานมาที่ชั้น 4 โรงพยาบาลสงขลานครินทร์

       ปัจจุบันสาขาวิชาจักษุวิทยาตั้งอยู่ที่ชั้น 4 ของตึกโรงพยาบาลสงขลานครินทร์สาขาวิชาจักษุวิทยาประกอบด้วยคลินิกตา (OPD) ตั้งอยู่ที่ชั้น 1 ห้องผ่าตัดตา (OR) ตั้งอยู่ที่ชั้น 3

สำนักงานภาควิชาตั้งอยู่ที่ชั้น 4 และหอผู้ป่วยตา (Ward) ตั้งอยู่ที่ชั้น 6

       โรงพยาบาลสงขลานครินทร์ ได้ใช้ระบบคอมพิวเตอร์ในการจัดการรักษาพยาบาลมาเป็นเวลานานกว่า 10 ปี ระบบ Hospital Information System (HIS) นี้ ได้รับการพัฒนาขึ้นด้วยบุคลากรของคณะแพทย์เอง จึงเป็นระบบที่ตรงความต้องการในการใช้งาน ง่าย สะดวก และมีความปลอดภัยจากการคุกคามจากระบบคอมพิวเตอร์ภายนอก ซึ่งเป็นระบบ paperless

ที่มีชื่อเสียงในระดับประเทศ